Il tempio B si erge su un alto podio alle spalle del teatro e insieme ad esso costituisce un complesso monumentale edificato secondo un progetto unitario. La presenza di numerose iscrizioni permette di identificare lo stato sannitico come committente della grande impresa edilizia.
La struttura templare più grande del Sannio presenta sui lati lunghi due terrazze con ambienti porticati. Il pronao, insolitamente allungato, presenta sulla fronte quattro colonne con capitelli corinzi. Una scalinata centrale collega il tempio ad un piano pavimentato, su cui sono posizionati gli altari. L’edificio si compone di tre celle: quella centrale si estende fino al muro di fondo, mentre le due laterali si interrompono creando due ambienti in cui erano custoditi i tesori. Le celle avevano una pavimentazione in mosaico bianco mentre quella del pronao è stata asportata e riutilizzata nella chiesa di S. Maria Assunta nel paese di Pietrabbondante.